CC BY-NC-ND 4.0 · Laryngorhinootologie 2020; 99(S 02): S100
DOI: 10.1055/s-0040-1711609
Abstracts
Onkologie

Transkriptomische Unterschiede zytotoxischer T-Zellen im entzündeten vs. nicht-entzündeten Tumormikromilieu von Kopf-Hals-Plattenepithelkarzinomen (HNO-PECs)

C Kürten
1   Universitätsklinikum Essen, Klinik für Hals-Nasen und Ohrenheilkunde, Essen
,
A Kulkarni
2   UPMC Hillman Cancer Center, Cancer Immunology and Immunotherapy Program, Pittsburgh, Vereinigte Staaten von Amerika
,
L Vujanovic
3   University of Pittsburgh, Department of Immunology, Pittsburgh, Vereinigte Staaten von Amerika
,
AR Cillo
3   University of Pittsburgh, Department of Immunology, Pittsburgh, Vereinigte Staaten von Amerika
,
X Lu
4   University of Pittsburgh, Deparment of Biomedical Informatics, Pittsburgh, Vereinigte Staaten von Amerika
,
S Lang
5   Universitätsklinikum Essen, Klinik für Hals-Nasen und Ohrenheilkunde, Essen, Vereinigte Staaten von Amerika
,
RL Ferris
2   UPMC Hillman Cancer Center, Cancer Immunology and Immunotherapy Program, Pittsburgh, Vereinigte Staaten von Amerika
› Author Affiliations
 
 

    Einführung: Stroma-, Tumor- und Immunzellen im Mikromilieu von HNO-PECs nutzen Resistenzmechanismen gegen Immuntherapien, was zu einer niedrigen Ansprechrate führt (15-20 %). Wir verwenden Einzelzell-RNA-Seuqenzierung (ScRNAseq), um Unterschiede zwischen entzündeten und nicht-entzündeten Mikromillieus zu untersuchen.

    Methoden 19 HNO-PECs wurden zerkleinert, um Einzelzellsuspensionen herzustellen, und in CD45+ and CD45- Proben sortiert. ScRNAseq wurde mit den 10x Genomics 3’ single cell kits durchgeführt. Der Infiltrationsstatus wurde anhand vom H&E-Färbungen bestimmt. Aggregation und Normalisation wurden mittels CellRanger durchgeführt, die Visualization mit dem Scanpy-Packet.

    Ergebnisse Wir identifizierten 31 Zell-Cluster, wovon 22 von Immun-Zellen sowie 9 von Nicht-Immunzellen gebildet wurden. Immunezelltypen (B Zellen, zytotoxische T Zellen, regulatorische T Zellen, etc.) sowie Zell-Zustände (Aktivierung, Zellalterung, Dysfunktionalität) wurden unterschieden. Entzündete Tumoren (n = 9) zeigten eine höhere Infiltration von CD8+ T Zellen im Vergleich zu nicht- entzündeten. Gene set enrichment Analysen zeigten, dass IFNγ- und IFNα-Reaktionen genauso wie Allograft-Abstoßungs-typische Gensets mit CD8+ T Zellen von entzündeten Tumoren assoziiert waren, während T-Zellen aus nicht-entzündeten Tumoren TNF-, Apoptose und Hypoxie Gensets hochregulierten. Des Weiteren zeigten zytotoxische T Zellen aus entzündeten Tumoren eine Anreicherung von Effektor-Genen wie NKG7 und CCL5, GZMH.

    Fazit Unter Verwendung von scRNAseq in HNO-PECs konnten wir eine Effektor-ähnliche Differenzierung zytotoxischer T-Zellen im entzündeten Tumor-Mikromillieu belegen. Dies unterstreicht die Relevanz qualitativer (und nicht nur quantitativer) Unterschiede in der Bestimmung der Tumor-Immuninfiltration.

    Poster-PDF A-1170.PDF


    #

    Programm zur internen Forschungsförderung Essen (IFORES)

    Robert L. Ferris
    UPMC Hillman Cancer Center, Cancer Immunology and Immunotherapy Program
    5150 Centre Ave
    15232 Pittsburgh
    Vereinigte Staaten von Amerika   

    Publication History

    Article published online:
    10 June 2020

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