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DOI: 10.1055/a-1023-4339
Automatisierte Zellzählung in Spenderhornhäuten aus Organkultur mittels „Deep Learning“ erreicht hohe Präzision und Genauigkeit
Automated Cell Counting Using “Deep Learning” in Donor Corneas from Organ Culture Achieves High Precision and AccuracyPublication History
eingereicht 21 July 2019
akzeptiert 16 September 2019
Publication Date:
05 December 2019 (online)
Zusammenfassung
Hintergrund Ein Hornhauttransplantat aus Organkultur darf i. d. R. nur verwendet werden, wenn präoperativ eine Endothelzelldichte von mindestens 2000 Zellen pro mm2 nachgewiesen ist. Die Messung der Endothelzelldichte ist dadurch erschwert, dass in der Phasenkontrastmikroskopie die Zellgrenzen der Endothelzellen nicht immer gut sichtbar sind und die zählbare Fläche durch quellungsbedingte Descemet-Falten limitiert ist. Bislang ist daher keine automatische Methode zur Endothelzelldichtebestimmung in Hornhauttransplantaten verfügbar. Das neuronale Netzwerk U-Net hat sich in der vollautomatischen Analyse von spiegelmikroskopischen Aufnahmen des Hornhautendothels bewährt. Ziel dieser Studie war die Anwendung des U-Net in der Qualitätssicherung von Hornhauttransplantaten.
Material und Methoden Das U-Net wurde zunächst anhand von 100 manuell markierten Befundungsbildern von Hornhäuten aus der Lions-Hornhautbank Baden-Württemberg trainiert. Für die Prüfung der Messgenauigkeit des U-Net wurden 100 weitere Befundungsbilder von der o. g. Hornhautbank zur Verfügung gestellt. Diese wurden jeweils von a) einer erfahrenen Befunderin und b) einem weniger erfahrenen Augenarzt manuell gezählt. Die identischen Bilder wurden vollautomatisch über das trainierte U-Net ausgezählt und dieses Ergebnis mit beiden manuellen Analysen mittels Pearson-Korrelation verglichen.
Ergebnisse Der Korrelationskoeffizient zwischen dem U-Net und der erfahren Untersucherin als „Goldstandard“ betrug 0,90. Der Korrelationskoeffizient des weniger erfahrenen Augenarztes mit dem Goldstandard betrug nur 0,81. Beide Korrelationen erwiesen sich als statistisch hochsignifikant (p < 0,0001).
Schlussfolgerung Die enge Korrelation des U-Net mit dem „Goldstandard“ deutet darauf hin, dass mit dem U-Net, die medizintechnische Zulassung vorausgesetzt, eine effektive Unterstützung in der Qualitätsbeurteilung von Hornhauttransplantaten in der Hornhautbank möglich ist. Dies hätte Vorteile für die Objektivität und die Arbeitseffizienz.
Abstract
Background Human corneal grafts from organ culture need to have more than 2000 endothelial cells/mm2 to be suitable for transplantation. Measurement of the endothelial cell density is complicated by invisible cell borders in phase contrast microscopy, as well as by limited areas for counting due to folds in the Descemet membrane of the swollen corneal grafts. To date, no automated counting method for measuring the endothelial cell density exists. The neuronal network U-Net has already proven itself in automated segmentation of specular microscopy images of human corneal endothelium. The aim of this study was the application of the U-Net in the quality control of human corneal grafts.
Material and Methods Training of the U-Net was performed using 100 manually tagged endothelial cell images of corneal grafts from the Lions eye bank in Baden-Württemberg. Another 100 images were obtained for testing the precision of measurements of the U-Net. These were adjudged manually by a) an experienced investigator and b) a less experienced ophthalmologist. The endothelial cells in identical images were then counted automatically by the trained U-Net. Comparison with the manually counted results was drawn by Pearson correlation.
Results The correlation coefficient between the U-Net and the experienced investigator as gold standard was 0.9. The correlation coefficient between the less experienced ophthalmologist and the gold standard was only 0.81. Both correlations were statistically highly significant (p < 0.0001).
Discussion The strong correlation between the U-Net and the gold standard points out that, given medical approval, effective assistance for eye banks is possible in quality control by automated counting. This could improve objectivity and efficiency of work flow.
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