Ein gesundes Darmmikrobiom ist mit einem Gleichgewicht von entzündungsfördernden und entzündungshemmenden Reaktionen im Darm verbunden. Mikroben gedeihen auf Nahrungssubstraten. Dennoch gibt es wenige Erkenntnisse darüber, inwieweit sich Vollwertkost und allgemeine Ernährungsmuster auf die Darmmikrobiota und den Wirt auswirken. Auch die Frage, ob diese Auswirkungen im gesunden anders als im entzündeten Darm ablaufen, ist bislang ungeklärt.