Die Darmflora und auch ihre Stoffwechselprodukte können wertvolle Informationen zum Gesundheitszustand einer Person liefern – so werden bestimmte Mikrobenstämme bspw. mit systemischen Erkrankungen in Verbindung gebracht und eine Dysbiose des Darmmikrobioms kann den Verlauf von Herz-Kreislauf- aber auch von Krebserkrankungen beeinflussen. Allerdings sind die derzeitigen Ansätze zur Analyse der Darmflora und ihrer Metabolite begrenzt.
