Genetische Faktoren als auch eine glutenhaltige Ernährung sind wichtige Faktoren für die Entwicklung einer Zöliakie. Es gibt Hinweise, dass auch eine veränderte Darmflora das Risiko für eine Zöliakie erhöht. Constante et al. charakterisierten die Zöliakie-Mikrobiota im Zwölffingerdarm und im Stuhl und überprüften die funktionellen Auswirkungen bei gnotobiotischen Mäusen.