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Senologie - Zeitschrift für Mammadiagnostik und -therapie 2024; 21(01): 40-50
DOI: 10.1055/a-2238-9615
Wissenschaftliche Arbeit

Ganz-Exom-Sequenzierung zur Bestimmung zielgerichteter Therapien für Patientinnen mit metastasiertem Mammakarzinom – eine Machbarkeitsstudie

Whole Exome Analysis to Select Targeted Therapies for Patients with Metastatic Breast Cancer – A Feasibility Study
Bernadette Anna Sophia Jaeger
1   Klinik für Frauenheilkunde und Geburtshilfe, Universitätsklinikum und Medizinische Fakultät der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Deutschland
,
Natalia Krawczyk
1   Klinik für Frauenheilkunde und Geburtshilfe, Universitätsklinikum und Medizinische Fakultät der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Deutschland
,
Anna Sophia Japp
2   Institut für Pathologie, Universitätsklinikum und Medizinische Fakultät der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Deutschland
,
Ellen Honisch
1   Klinik für Frauenheilkunde und Geburtshilfe, Universitätsklinikum und Medizinische Fakultät der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Deutschland
,
Karl Köhrer
3   Biologisch-Medizinisches Forschungszentrum (BMFZ), Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Germany
,
Sibylle Scheuring
3   Biologisch-Medizinisches Forschungszentrum (BMFZ), Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Germany
,
Patrick Petzsch 
3   Biologisch-Medizinisches Forschungszentrum (BMFZ), Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Germany
,
Hans Neubauer
1   Klinik für Frauenheilkunde und Geburtshilfe, Universitätsklinikum und Medizinische Fakultät der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Deutschland
,
Anne Kathrin Volkmer
1   Klinik für Frauenheilkunde und Geburtshilfe, Universitätsklinikum und Medizinische Fakultät der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Deutschland
,
Irene Esposito
2   Institut für Pathologie, Universitätsklinikum und Medizinische Fakultät der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Deutschland
,
Eugen Ruckhäberle
1   Klinik für Frauenheilkunde und Geburtshilfe, Universitätsklinikum und Medizinische Fakultät der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Deutschland
,
Dieter Niederacher
1   Klinik für Frauenheilkunde und Geburtshilfe, Universitätsklinikum und Medizinische Fakultät der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Deutschland
,
Tanja Fehm
1   Klinik für Frauenheilkunde und Geburtshilfe, Universitätsklinikum und Medizinische Fakultät der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Düsseldorf, Deutschland
› Author AffiliationsSupported by: | Förderung Krebsforschung Nordrhein-Westfalen e. V. |
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Zusammenfassung

Einleitung Ziel dieser Machbarkeitsstudie war es, zielgerichtete Therapien entsprechend der ESCAT-Skala (ESMO Scale for Clinical Actionability of molecular Targets) zu bestimmen. Für die Interpretation der Daten wurde eine browserbasierte Plattform zur Entscheidungsfindung (MH Guide, Molecular Health, Heidelberg, Germany) eingesetzt.

Patientinnen Es wurde eine Exomsequenzierung von Tumorgewebe und peripherem Blut von Patientinnen mit metastasiertem Mammakarzinom (n = 44) durchgeführt, um somatische sowie Keimbahnmutationen zu identifizieren.

Ergebnisse Bei 32 Patientinnen mit metastasiertem Mammakarzinom konnte eine Dateninterpretation durchgeführt werden. Es wurden 25 genomische Veränderungen (ESCAT-Evidenzstufe I oder II) bei 18/32 Patientinnen mit metastasiertem Mammakarzinom identifiziert und abschließend ausgewertet: Darunter fanden sich 3 Fälle mit erhöhter Kopienzahl bei HER2, 2 gBRCA1-, 2 gBRCA2-, 6 PIK3CA-, 1 ESR1-, 3 PTEN-, 1 AKT1- und 2 HER2-Mutationen. Dazu kamen noch 5 Proben, die eine hochgradige Mikrosatelliten-Instabilität aufwiesen.

Schlussfolgerung Die daraus abzuleitenden Behandlungsoptionen wurden in einer Tumorkonferenz diskutiert und dann einer kleinen, aber relevanten Anzahl von Patientinnen mit metastasiertem Mammakarzinom (7/18) empfohlen. Die hier vorgestellte Arbeit stellt eine wertvolle Machbarkeitsstudie dar, die dazu beitragen kann, molekulare Tumorboards innerhalb des Deutschen Netzwerks für Personalisierte Medizin zu etablieren. Ziel ist, die für Analysen benötigte Zeit zu verkürzen und die Wahl zielgerichteter Therapien zu optimieren.

Abstract

Introduction The purpose of this feasibility study was to select targeted therapies according to the “ESMO Scale for Clinical Actionability of molecular Targets (ESCAT)”. Data interpretation was further supported by a browser-based Treatment Decision Support platform (MH Guide, Molecular Health, Heidelberg, Germany).

Patients We applied next generation sequencing based whole exome sequencing of tumor tissue and peripheral blood of patients with metastatic breast cancer (n = 44) to detect somatic as well as germline mutations.

Results In 32 metastatic breast cancer patients, data interpretation was feasible. We identified 25 genomic alterations with ESCAT Level of Evidence I or II in 18/32 metastatic breast cancer patients, which were available for evaluation: three copy number gains in HER2, two gBRCA1, two gBRCA2, six PIK3CA, one ESR1, three PTEN, one AKT1 and two HER2 mutations. In addition, five samples displayed Microsatellite instability high-H.

Conclusions Resulting treatment options were discussed in a tumor board and could be recommended in a small but relevant proportion of patients with metastatic breast cancer (7/18). Thus, this study is a valuable preliminary work for the establishment of a molecular tumor board within the German initiative “Center for Personalized Medicine” which aims to shorten time for analyses and optimize selection of targeted therapies.

Schlüsselwörter

Mammakarzinom - zielgerichtete Therapie - Ganz-Exom-Sequenzierung - Entscheidungsplattform

Keywords

breast cancer - targeted therapy - whole exome sequencing - decision making platform

Supplement



Publication History

Received: 30 April 2023

Accepted after revision: 09 August 2023

Article published online:
22 March 2024

© 2023. This article was originally published by Thieme as Bernadette Anna Sophia Jaeger et al. Whole Exome Analysis to Select Targeted Therapies for Patients with Metastatic Breast Cancer – A Feasibility Study. Geburtsh Frauenheilk 2023; 83: 1138–1147 as an open access article under the terms of the Creative Commons Attribution-NonDerivative-NonCommercial-License, permitting copying and reproduction so long as the original work is given appropriate credit. Contents may not be used for commercial purposes, or adapted, remixed, transformed or built upon. (https:// creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/)

Georg Thieme Verlag KG
Rüdigerstraße 14, 70469 Stuttgart, Germany

 

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