Molekularbiologische Charakterisierung des kaninen Prostatakarzinom – welche Erkenntnisse liefern Next-Generation-RNA-Sequenzierungen?

Einleitung Zur Verbesserung der Diagnostik des kaninen Prostatakarzinoms und der limitierten therapeutischen Ansätze ist ein besseres Verständnis auf molekularer Ebene essenziell. Hochdurchsatz-RNA-Sequenzierungen (RNA-Seq) ermöglichen die Generierung komplexer molekularer Signaturen auch aus geringen Probenvolumina. Ziel der Studie war, Prostatakarzinom-Proben aus ultraschallgeführten Feinnadelaspirationsbiopsien (US-FNA) und Gewebe (PG) der kaninen Prostata gegenüber nichtmalignen Proben auf molekularer Ebene zu charakterisieren.
Methoden Elf maligne (PG n = 9, US-FNA n = 2) und 14 nichtmaligne (PG=9, US-FNA n = 5) Proben wurden über RNA-Seq mittels Illumina NextSeq500 charakterisiert und bioinformatisch ausgewertet.
Ergebnisse Die funktionelle Analyse der deregulierten Gene in malignen Proben zeigt Veränderungen in Zellzyklus- und Entzündungspathways. Verschiedene Tumorsuppressor- und Onkogene konnten im cancer related pathway sowie PI3K-Akt, VEGF, ErbB signaling pathway identifiziert werden.
Schlussfolgerung RNA-Seq-Daten identifizierten deregulierte Gene, auf deren Basis diagnostische und therapeutische Ansätze für weitere Studien zum kaninen Prostatakarzinom erarbeitet werden können.