Massive Parallelsequenzierung therapierelevanter Gene mit dem Dog-Cancer-Hotspot-Panel, eine Option für die pathologische Routinediagnostik?

Einleitung:

In der Veterinärmedizin ist die zielgerichtete Krebstherapie aufgrund weniger bekannter tumorspezifischer genetischer Aberrationen sowie der in der Routinediagnostik nicht einsetzbaren Tiefensequenzierungsmethoden nur vereinzelt möglich. Zielsetzung dieser Studie war die Etablierung eines Panels für die massive Parallelsequenzierung kaniner Neoplasien zur gezielten Analyse von Mutationshotspots in einer Vielzahl von Genen in einem Ansatz.

Material und Methoden:

Basierend auf dem Ion AmpliSeq Cancer Hotspot Panel v2 wurde ein kanines Panel erstellt und modifiziert. Die Sequenzierung erfolgte mit dem IonTorrent PGM System aus formalinfixiertem, paraffineingebettetem Normal- und Tumorgewebe von 4 einfachen und einem komplexen kaninen Mammakarzinom.

Befunde:

Zwei Tiere wiesen Hotspot-Mutationen im KRAS-Gen auf, 2 weitere eine TP53-Mutation. Ein TP53-mutierter Fall hatte zusätzlich eine Mutation im PTEN-Gen. Bei 2 Hunden lagen Keimbahnmutationen (ERBB2, BRCA2) vor. Ein Fall wies keine genetischen Alterationen in den untersuchten Genen auf.

Schlussfolgerung:

Next Generation Sequencing mit dem Dog Cancer Hotspot Panel eignet sich für die Detektion möglicher therapierelevanter genetischer Aberrationen und erlaubt darüber hinaus eine feinere Kartierung des kaninen Genoms.