1987 erwarb der private Klinikbetreiber Sana 50 Prozent der Anteile des RKU, das drei Jahre zuvor seinen Betrieb aufgenommen hatte. 1999 stieß das Uniklinikum Ulm als Mitgesellschafter dazu. Seit 2015 laufen die Gespräche um eine angemessene Beteiligung des Uniklinikums Ulm bei Entscheidungen des RKU.