Professor Bernd Hamm ist seit März 1994 Direktor der Klinik für Radiologie der Charité (Campus Mitte), mit Integration und Fusion der Klinik für Radiologie des Campus Virchow-Klinikum seit 2006 und der Klinik für Radiologie Campus Benjamin Franklin seit 2010. Seit 2006 ist er Ärztlicher Leiter des CharitéCentrum 6 (Diagnostische und Interventionelle Radiologie/Neuroradiologie/Kinderradiologie/Nuklearmedizin/Medizinische Physik) mit Übernahme der Budgetverantwortung für die genannten Bereiche der Charité.
Seit 2018 ist er Sprecher des Sonderforschungsbereiches 1340 „In vivo Darstellung pathologischer Veränderungen der Extrazellulärmatrix – Matrix in Vision“, welcher im Sommer 2022 für weitere 4 Jahre verlängert worden ist.
Professor Hamm ist Ehrenmitglied der Deutschen Röntgengesellschaft.