Synlett 2011(10): 1375-1380  
DOI: 10.1055/s-0030-1260573
LETTER
© Georg Thieme Verlag Stuttgart ˙ New York

An Integrated Flow and Batch-Based Approach for the Synthesis of O-Methyl Siphonazole

Marcus Baumann, Ian R. Baxendale, Malte Brasholz, John J. Hayward, Steven V. Ley, Nikzad Nikbin
Innovative Technology Centre, Department of Chemistry, University of Cambridge, Lensfield Road, Cambridge CB2 1EW, UK
e-Mail: theitc@cam.ac.uk;
Further Information

Publication History

Received 21 February 2011
Publication Date:
23 May 2011 (online)

Abstract

The bisoxazole containing natural product O-methyl siphonazole was assembled using a suite of microreactors via a flow-based approach in concert with traditional batch methods. The use of a toolbox of solid-supported scavengers and reagents to aid purification afforded the natural product in a total of nine steps.

    References and Notes

  • 1a Bull JA. Balskus EP. Horan RAJ. Langner M. Ley SV. Angew. Chem. Int. Ed.  2006,  45:  6714 
  • 1b Bull JA. Balskus EP. Horan RAJ. Langner M. Ley SV. Chem. Eur. J.  2007,  13:  5515 
  • 1c Enriquez-Garcia A. Ley SV. Collect. Czech. Chem. Commun.  2009,  74:  887 
  • 2 Nett M. Erol . Kehraus S. Köck M. Krick A. Eguevera E. Neu E. König GM. Angew. Chem. Int. Ed.  2006,  45:  3863 
  • 3a Linder J. Moody CJ. Chem. Commun.  2007,  1508 
  • 3b Linder J. Blake AJ. Moody CJ. Org. Biomol. Chem.  2008,  6:  3908 
  • 4a Zhang J. Ciufolini MA. Org. Lett.  2009,  11:  2389 
  • 4b Zhang J. Polishchuk EA. Chen J. Ciufolini MA. J. Org. Chem.  2009,  74:  9140 
  • 5a Noël T. Naber JR. Hartman RL. McMullen JP. Jensen KF. Buchwald SL. Chem. Sci.  2011,  2:  287 
  • 5b Ceylan S. Coutable L. Wegner J. Kirschning A. Chem. Eur. J.  2011,  17:  1884 
  • 5c Polyzos T. O’Brien M. Petersen TP. Baxendale IR. Ley SV. Angew. Chem. Int. Ed.  2011,  50:  1190 
  • 5d Ngamsom B. Hickey AM. Greenway GM. Littlechild JA. McCreedy T. Watts P. Wiles C. Org. Biomol. Chem.  2010,  8:  2419 
  • 5e Bagley MC. Fusillo V. Jenkins RL. Lubinu MC. Mason C. Org. Biomol. Chem.  2010,  8:  2245 
  • 5f Wegner J. Ceylan S. Friese C. Kirschning A. Eur. J. Org. Chem.  2010,  4372 
  • 5g McMullen JP. Stone MT. Buchwald SL. Jensen KF. Angew. Chem. Int. Ed.  2010,  49:  7076 
  • 5h McMullen JP. Jensen KF. Org. Process Res. Dev.  2010,  14:  1169 
  • 5i Damm M. Glasnov TN. Kappe CO. Org. Process Res. Dev.  2010,  14:  215 
  • 5j Riva E. Gagliardi S. Martinelli M. Passarella D. Vigo D. Rencurosi A. Tetrahedron  2010,  66:  3242 
  • 5k Amemiya F. Fuse K. Fuchigami T. Atobe M. Chem. Commun.  2010,  46:  2730 
  • 5l Brandt JC. Elmore SC. Robinson RI. Wirth T. Synlett  2010,  3099 
  • 5m Nagaki A. Takabayasi N. Tomida Y. Yoshida J. Beilstein J. Org. Chem.  2009,  5:  No. 16 
  • 5n Gustafsson T. Pontén F. Seeberger PH. Chem. Commun.  2008,  26:  1100 
  • 5o Sahoo HR. Kralji JG. Jensen KF. Angew. Chem. Int. Ed.  2007,  46:  5704 
  • 5p Mason BP. Price KE. Steinbacher JL. Bogdan AR. MacQuade DT. Chem. Rev.  2007,  107:  2300 
  • 6a Baumann M. Baxendale IR. Ley SV. Mol. Diversity  2011, in press; DOI: 10.1007/s11030-010-9282-1
  • 6b Bogdan AR. James K. Chem. Eur. J.  2010,  16:  14506 
  • 6c Hessel V. Chem. Eng. Technol.  2009,  32:  1655 
  • 6d Ley SV. Baxendale IR. Chimia  2008,  62:  162 
  • 7a Irfan M. Glasnov TN. Kappe CO. Org. Lett.  2011,  13:  984 
  • 7b Martin LJ. Marzinzik AL. Ley SV. Baxendale IR. Org. Lett.  2011,  13:  320 
  • 7c Smith CJ. Nikbin N. Ley SV. Lange H. Baxendale IR. Org. Biomol. Chem.  2011,  9:  1938 
  • 7d Malet-Sanz L. Madrzak J. Ley SV. Baxendale IR. Org. Biomol. Chem.  2010,  8:  5324 
  • 7e McPake CB. Murray CB. Sandford G. Chimica oggi  2010,  26:  6 
  • 7f O’Brien M. Baxendale IR. Ley SV. Org. Lett.  2010,  12:  1596 
  • 7g Bartrum HE. Blakemore DC. Moody CJ. Hayes CJ. J. Org. Chem.  2010,  75:  8674 
  • 7h Brandt JC. Wirth T. Beilstein J. Org. Chem.  2009,  5:  No. 30 
  • 7i Bogdan AR. Sach NW. Adv. Synth. Catal.  2009,  351:  849 
  • 7j Baumann M. Baxendale IR. Nikbin N. Ley SV. Smith CD. Tierney JP. Org. Biomol. Chem.  2008,  6:  1577 
  • 7k Wiles C. Watts P. Eur. J. Org. Chem.  2008,  5597 
  • 7l Sandford G. J. Fluorine Chem.  2007,  128:  90 
  • 8a Hodgkinson JT. Galloway WRJD. Shreya S. Baxendale IR. Ley SV. Ladlow M. Welch M. Spring DR. Org. Biomol. Chem.  2011,  9:  57 
  • 8b Carter CF. Baxendale IR. Pavey JBJ. Ley SV. Org. Biomol. Chem.  2010,  8:  1588 
  • 8c Wheeler RC. Benali O. Deal M. Farrant E. MacDonald SJF. Warrington BH. Org. Process Res. Dev.  2007,  11:  704 
  • 8d Hornung CH. Mackley MR. Baxendale IR. Ley SV. Org. Process Res. Dev.  2007,  11:  399 
  • 8e Smith CJ. Iglesias-Sigüenza FJ. Baxendale IR. Ley SV. Org. Biomol. Chem.  2007,  5:  2758 
  • 8f Roberge DM. Ducry L. Bieler N. Cretton P. Zimmermann B. Chem. Eng. Technol.  2005,  28:  318 
  • 9a Rasheed M. Wirth T. Angew. Chem. Int. Ed.  2011,  50:  357 
  • 9b Smith CJ. Smith CD. Nikbin N. Ley SV. Baxendale IR. Org. Biomol. Chem.  2011,  9:  1927 
  • 9c Venturoni F. Nikbin N. Ley SV. Baxendale IR. Org. Biomol. Chem.  2010,  8:  1798 
  • 9d Baxendale IR. Griffiths-Jones CM. Ley SV. Tranmer GK. Synlett  2006,  427 
  • 10a Baumann M. Baxendale IR. Kirschning A. Ley SV. Wegner J. Heterocycles  2011,  82:  1297 
  • 10b Hopkin MD. Baxendale IR. Ley SV. Chem. Commun.  2010,  46:  2450 
  • 10c Qian Z. Baxendale IR. Ley SV. Chem. Eur. J.  2010,  16:  12342 
  • 10d Brasholz M. Johnson BA. Macdonald JM. Polyzos A. Tsanaktsidis J. Saubern S. Holmes AB. Ryan JH. Tetrahedron  2010,  66:  6445 
  • 10e Tamborini L. Conti P. Pinto A. Micheli CD. Tetrahedron: Asymmetry  2010,  21:  222 
  • 10f Herath A. Dahl R. Cosford NDP. Org. Lett.  2010,  12:  412 
  • 10g Baxendale IR. Schou S. Sedelmeier J. Ley SV. Chem. Eur. J.  2010,  16:  89 
  • 10h Baxendale IR. Ley SV. Mansfield AC. Smith CD. Angew. Chem. Int. Ed.  2009,  48:  4017 
  • 10i Baxendale IR. Deeley CM. Griffiths-Jones CM. Ley SV. Saaby S. Tranmer GK. Chem. Commun.  2006,  24:  2566 
  • 10j Baxendale IR. Ley SV. Smith CD. Tranmer GK. Chem. Commun.  2006,  4835 
  • 12a Middleton WJ. J. Org. Chem.  1975,  40:  574 
  • 12b Phillips AJ. Uto Y. Wipf P. Reno MJ. Williams DR. Org. Lett.  2000,  2:  1165 
  • Use of DAST in flow:
  • 12c Baumann M. Baxendale IR. Ley SV. Synlett  2008,  2111 
  • 12d Baumann M. Baxendale IR. Martin LJ. Ley SV. Tetrahedron  2009,  65:  6611 
  • 14 Williams DR. Lowder PD. Gu Y.-G. Brooks DA. Tetrahedron Lett.  1997,  38:  331 
  • 15 Doleschall G. Seres P. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1  1988,  1875 
  • 16Compound 12 was prepared by ring opening of 2,2,6-trimethyl-4H-1,3-dioxin-4-one with phenol, see:
  • 16 Clemens RJ. Hyatt JA. J. Org. Chem.  1985,  50:  2431 . Followed by diazo group transfer, see: Tullis JS. Helquist P. Org. Synth.  1997,  74:  229 
  • 17 Bagley MC. Buck RT. Hind SL. Moody CJ.
    J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1  1998,  591 
  • 18 Wipf P. Miller CP. J. Org. Chem.  1993,  58:  3604 
  • For related applications of PS-BEMP iminophosphorane base, see:
  • 20a Bensa D. Constantieux T. Rodriguez J. Synthesis  2004,  923 
  • 20b Baumann M. Baxendale IR. Ley SV. Smith CD. Tranmer GK. Org. Lett.  2006,  8:  5231 
  • 21a Krapcho AP. Jahngen EGE. Lovey AJ. Tetrahedron Lett.  1974,  15:  1091 
  • 21b Krapcho AP. Weimaster JF. Eldridge JM. Jahngen EGE. Lovey AJ. Stephens WP. J. Org. Chem.  1978,  43:  138 
  • 22a Mori K. Tetrahedron  1974,  30:  3810 
  • 22b Grieco PA. Galatsis P. Spohn RF. Tetrahedron  1986,  42:  2847 
  • 23 Poulain RF. Tartar AL. Déprez BP. Tetrahedron Lett.  2001,  42:  1495 
11

Vapourtec© R2+/R4 system was used; website: www.vapourtec.co.uk.

13

QP-SA and QP-DMA resins are commercially available from Johnson Matthey. Website: http://www.matthey.com/.

19

An Omnifit column was used, www.omnifit.com.

24

NMR Data
¹H NMR (600 MHz, CDCl3): δ = 2.64, 2.67 (2 s, 2 × 3 H, 18-H, 19-H), 3.92, 3.93 (2 s, 2 × 3 H, 20-H, 21-H), 4.03 (t, J = 5.8 Hz, 2 H, 1′-H), 4.41 (s, 2 H, 5-H), 5.06 (d, J = 10.3 Hz, 1 H, 5′-H), 5.18 (d, J = 17.0 Hz, 1 H, 5′-H), 5.73 (td, J = 5.8, 15.0 Hz, 1 H, 2′-H), 6.22 (dd, J = 10.3, 15.0 Hz, 1 H, 3′-H), 6.31 (td, J = 10.3, 17.0 Hz, 1 H, 4′-H), 6.75 (d, J = 16.4, 1 H, 10-H), 6.88 (d, J = 8.2 Hz, 1 H, 16-H), 7.00 (t, J = 5.8 Hz, 1 H, NH), 7.07 (d, J = 1.6 Hz, 1 H, 13-H), 7.09 (dd, J = 1.6, 8.2 Hz, 1 H, 17-H), 7.44 (d, J = 16.4 Hz, 1 H, 11-H) ppm. ¹³C NMR (150 MHz): δ = 11.7, 12.4 (2 q, C-18, C-19), 39.4 (t, C-5), 40.3 (t, C-1′), 55.9, 56.0 (2 q, C-20, C-21), 108.9 (d, C-13), 110.8 (d, C-10), 111.2 (d, C-16), 117.4 (t, C-5′), 121.5 (d, C-17), 128.1 (s, C-12), 129.45, 129.49 (2 d, C-2′, C-3′), 132.8 (s, C-2), 134.5 (s, C-7), 136.1 (d, C-4′), 137.3 (d, C-11), 149.3, 150.6 (2 s, C-14, C-15), 153.8 (s, C-3), 155.3 (s, C-8), 155.6 (s, C-4), 159.1 (s, C-9), 161.7 (s, C-1), 189.4 (s, C-6) ppm.