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DOI: 10.1055/s-0041-1727860
Tumor-exklusive Peptide von gemeinsamen und individuellen Antigenen im HLA-Ligandom von oropharyngealen Plattenepithelkarzinomen
Einleitung Tumor Antigene werden dem Immunsystem über Humane Leukozyten Antigene (HLA) präsentiert. Das HLA-Ligandom oropharyngealer Plattenepithelkarzinome (OPSCC) wurde bisher nicht charakterisiert. Material und Methoden: OPSCC Biopsien von 40 Patienten und Tonsillengewebe 5 gesunder Spender wurden analysiert. HLA-Moleküle wurden aus frisch gefrorenen Biopsien extrahiert, die HLA-Liganden mit Hilfe von Hochleistungsflüssigkeitschromatographie isoliert und mittels Tandem Massenspektrometrie (MS/MS) ausgewertet. Tumor-exklusive Peptide (TEP) wurden durch Vergleich mit dem Ligandom gesunder Tonsillengewebe und einer HLA-Ligandom Datenbank gut- / bösartiger Gewebe identifiziert. RNA- und DNA Sequenzierungen wurden zusätzlich durchgeführt.
Ergebnisse OPSCC wurden mittels RNA-seq Daten in HPV+ (n=22) oder HPV- (n=18) klassifiziert. Es wurden 25228 HLA Klasse I präsentierte Peptide aus 9485 Quellproteinen und 15203 HLA Klasse II präsentierte Peptide aus 4634 Quellproteinen detektiert. Peptide der Cancer-Testis Antigene IMP3, KDM5B, CTNNA2 und ATAD2 wurden bei = 30 % der Patienten gefunden. Insgesamt wurden 3746 HLA Klasse I TEP und 5096 HLA Klasse II TEP identifiziert. Einige TEP wurden ausschließlich in HPV+ oder HPV- gefunden, während andere sowohl in HPV+ als auch in HPV- detektiert wurden.
Schlussfolgerung Das HLA-Ligandom von OPSCC enthält sowohl gemeinsame als auch individuelle TEP und unterscheidet sich abhängig vom HPV-Status. Auf Basis dieser Ergebnisse könnte die Entwicklung semi-personalisierter oder personalisierter Tumorimpfungen erfolgen.
Poster-PDF A-1495.pdf
DFG (GRK-2254), Universität Ulm (Clinician Scientist Programme)
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Interessenkonflikt
Der Erstautor weist auf folgenden Interessenkonflikt hin: Simon Laban: Advisory Boards: Merck Sharp & Dohme (MSD), Bristol Myers Squibb (BMS), Astra Zeneca (AZ). Honoraria: MSD, BMS, AZ, Merck Serono.Johannes Döscher: Advisory Boards: Merck Serono. MSD. Honoraria: Merck Serono.Patrick J. Schuler: Advisory Boards: BMS, MSD.Thomas K. Hoffmann: Advisory Boards: MSD, BMS. Honoraria: MSD, BMS, Merck Serono.
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13 May 2021
© 2021. The Author(s). This is an open access article published by Thieme under the terms of the Creative Commons Attribution-NonDerivative-NonCommercial-License, permitting copying and reproduction so long as the original work is given appropriate credit. Contents may not be used for commercial purposes, or adapted, remixed, transformed or built upon. (https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).
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